浙江机电职业技术学院历史悠久，从1952年创办浙江省杭州工人技术学校、1975年创办浙江机械工业学校、2002年经浙江省人民政府批准并经教育部备案正式成立浙江机电职业技术学院，至今已有70年办学历史。
自动化学院的渊源可以追溯至上世纪50年代的浙江省杭州工人技术学校、浙江机械专科学校杭州工学院的电机系。1977年文革结束复校设立浙江机械工业学校电机电器专业，1984年成立电气科，1999年，成立电气电子工程系，2013年，由系升格为电气电子工程学院，2020年，改为自动化学院。2007年机电一体化技术专业成为国家示范性高等职业院校重点建设专业，2016年智能控制技术专业群入选浙江省重点校重点建设专业群，2019年，智能控制技术专业群入选中国特色高水平高职学校建设单位（A档前十）重点建设专业群。
自动化学院设有机电一体化技术、电气自动化技术、应用电子技术、智能控制技术三年制专业4个，自动化（机电一体化技术）四年制专业1个，自动化两年制本科专业1个。
